台南市擁有豐富的紅樹林濕地與鹽田環境,這些溼地孕育了許多的底棲生物,成了許多水鳥的食物來源。優渥的環境使得本區鳥類繁多。主要以鷸科、鴴科、鷺科、鷗科、雁鴨科為大宗,沿岸防風林、木麻黃樹林聚集小白鷺、夜鷺混居成為鷺鷥築巢區,林下草澤粟小鷺、喜鵲、翠鳥等亦為常見鳥類。

冬季則常見大白鷺及中白鷺在林內棲息,棕背伯勞亦屬常見候鳥,大魚塭小池塘悠游的紅冠水雞。除此尚有海鷗穿梭於沿海及港灣附近,停佇在外海蚵架上,而稀有的鳥類如唐白鷺、巴鴨、黑嘴鷗、高蹺鴴、松雀鷹、燕鴴等均在本區出現過。

                    
大白鷺                                                                                                  大杓鷸

                          
小水鴨                                                                                           小白額雁

                    
小白鷺                                                                                             反嘴鴴

                      
白眉鴨                                                                                               赤頸鴨

                       
夜鷺                                                                                                   高蹺鴴

                      
黑面琵鷺                                                                                              黃頭鷺


尖尾鴨

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